我院本草基因组学团队在jpha连续发表两篇论文
近日，成都中医药大学为第一单位署名在journal of pharmaceutical analysis杂志（中科院一区，top期刊，if=14）在线发表“dna barcoding in herbal medicine: retrospective and prospective”（草药dna条形码的过去与未来），该文论述了草药dna条形码技术的研究应用体系，提出了草药dna条形码研究的未来方向，为草药真伪鉴定提供新思路。我院陈士林首席教授为本论文的第一作者和通讯作者，尹显梅博士等为本论文共同作者。
图1：论文已在线发表于journal of pharmaceutical analysis
草药是人类繁衍生息的重要保障之一。现今在全球范围内草药及药用植物开发的保健品和食品依然在守护着人们的健康。十五年前，陈士林团队提出并建立dna条形码技术体系用于草药鉴定，在草药质量控制和国际药材贸易中发挥关键作用。该技术有效地避免草药误鉴定和人工掺假，促进草药产业健康可持续发展。
该论文通过回溯dna条形码技术应用于中草药鉴定的研究历程，详细介绍了近年来基于dna条形码技术在草药鉴定研究及应用情况。其中包括以its2和psba-trnh为代表的dna条形码序列因其在草药样品物种水平鉴定方面的优异表现被广泛应用，在此基础上构建了标准的、高物种覆盖的dna条形码数据库，为中草药基原物种识别提供参考序列，提高了基于dna条形码的物种识别的准确性和可信度；基于质体基因组的超级条形码迅速发展，在近缘物种鉴定中显示出明显优势；微形码（mini-barcode）在加工草药材料中表现出强劲鉴定能力；高通量测序（high-throughput sequencing）、等温扩增(isothermal amplification)、高分辨率熔解曲线（high resolution melting）等分子生物学技术与dna条形码结合用于草药鉴定，拓展了基于dna条形码的应用领域，开启了后dna条形码时代。论文还提出应该不断更新和完善dna条形码数据库，覆盖尽可能多的草药品种；促进药用植物全基因组和细胞器基因组测序，为分子标记选择、辅助育种实践和系统发育分析提供坚实的基础；对易混淆、通用条形码难以区分的近缘药材开发新的特异性基因位点，以保证临床用药的准确性；将dna条形码与理化分析相结合，实现药材质量的综合评价；以市场需求为导向，开发可靠、快速的dna条形码集成现场分子技术；结合高通量测序技术和dna条形码技术对混合药材进行物种定量，对损伤程度较高的样品进行定性工作；进一步将dna条形码技术引入中药种子、苗木、药材、饮片、中成药等全过程，实现全过程监管和溯源。
图2 dna条形码及其衍生技术在中药资源鉴定中的应用
今年2月，陈士林首席教授还作为共同通讯作者在journal of pharmaceutical analysis发表了题为“progress and prediction of multicomponent quantification in complex systems with practical lc-uv methods”（基于实用性的lc-uv对复杂体系多组分定量分析研究）的文章（原文链接：https://doi.org/10.1016/j.jpha.2022.11.011）。该文论述了ssdmc方法的发展过程、应用现状及其在复杂体系分析中的应用案例。从如何提升多成分分析方法建立效率的角度，对液相分时色谱柱的合理选择和二维液相分析方法构建进行综述。介绍了预测色谱条件和分析参数的计算机软件技术，为分析方法的智能化发展提供了方法思路。
原文链接：
论文1.https://doi.org/10.1016/j.jpha.2023.03.008
论文2.https://doi.org/10.1016/j.jpha.2022.11.011